Durch das Öffnen gelangt Sauerstoff in den Behälter und es bilden sich aus dem Produkt Hefeteilchen. Dies ist also kein Schimmel, sondern gehört zum Produkt. Durch Schütteln des Behälters lösen sich die Hefeteilchen wieder in der Flüssigkeit auf und sind somit nicht mehr sichtbar. Sie können aber auch entfernt werden.
EM-1 ist solange zur Weitervermehrung tauglich, als der pH-Wert nicht über 3,6 steigt und das Produkt seinen typischen süßsäuerlichen Geruch hat. Dasselbe gilt für die Qualität von EMa, wobei hier der pH-Wert bis auf 3,9 ansteigen kann, ohne dass das Produkt schlechter geworden sein muss.